- É órgão de âmbito universal, que congrega todos os Pastores da INSJCM cuja principal competência consiste em velar pelo bom exercício do ministério pastoral e assegurar a formação e capacitação permanentes dos Ministros de Culto, agrupando-os em categorias de carreira especifica.
- A Junta Eclesiástica de Pastores é superiormente coordenada pelo Líder Espiritual, apoiado por um Corpo de Responsáveis por si designados.